麻省理工學(xué)院 | 新工具可以幫助識(shí)別碳水化合物結(jié)合蛋白
指南者留學(xué)
2022-12-23 13:22:48
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<p>研究碳水化合物的人一直在努力克服的一個(gè)主要障礙是,可用來(lái)破譯糖的作用的工具有限。作為一種變通辦法,大多數(shù)研究人員利用從植物或真菌中分離出來(lái)的凝集素(糖結(jié)合蛋白),但它們體積大,結(jié)合能力弱,并且在特異性和檢測(cè)糖的范圍上受到限制。在ACS化學(xué)生物學(xué)雜志上發(fā)表的一項(xiàng)新研究中,芭芭拉·Imperiali教授團(tuán)隊(duì)的研究人員開(kāi)發(fā)了一個(gè)平臺(tái)來(lái)解決這一缺陷。</p>
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<p>“碳水化合物聚合物的挑戰(zhàn)在于它們的生物合成不是模板驅(qū)動(dòng)的。”Imperiali說(shuō),他是該研究的資深作者,也是化學(xué)系和生物系的教授。“蛋白質(zhì)和核酸的技術(shù)進(jìn)步推動(dòng)了生物學(xué)、醫(yī)學(xué)和生物技術(shù)的發(fā)展。碳水化合物領(lǐng)域嚴(yán)重落后,正在拼命尋找工具。”</p>
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<p>識(shí)別碳水化合物結(jié)合蛋白</p>
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<p>生物合成碳水化合物需要一種特定的酶來(lái)合成單個(gè)糖分子之間的每一個(gè)鏈接,而且目前還沒(méi)有現(xiàn)成的方法來(lái)破譯復(fù)雜碳水化合物的結(jié)構(gòu)和序列。碳水化合物的抗體可以產(chǎn)生,但這樣做具有挑戰(zhàn)性,昂貴,并且產(chǎn)生的分子比研究真正需要的要大得多。對(duì)于這個(gè)機(jī)制有限的領(lǐng)域來(lái)說(shuō),一個(gè)理想的資源是發(fā)現(xiàn)大小有限的結(jié)合蛋白,它可以通過(guò)使用這些結(jié)合劑來(lái)識(shí)別小塊的碳水化合物,并將其拼湊成一個(gè)結(jié)構(gòu),或者是檢測(cè)和識(shí)別復(fù)雜結(jié)構(gòu)中的特定碳水化合物的方法。</p>
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<p>這項(xiàng)研究的作者使用定向進(jìn)化和聰明的篩選設(shè)計(jì),從完全沒(méi)有碳水化合物結(jié)合能力的蛋白質(zhì)中識(shí)別出碳水化合物結(jié)合蛋白。他們的發(fā)現(xiàn)為識(shí)別具有多樣化和可編程特異性的碳水化合物結(jié)合蛋白奠定了基礎(chǔ)。</p>
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<p><span class="h1"><strong>簡(jiǎn)化協(xié)作</strong></span></p>
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<p>這一進(jìn)步將使研究人員能夠在不受凝集素作用的限制,或不受產(chǎn)生抗體能力的挑戰(zhàn)的情況下,追蹤用戶定義的糖目標(biāo)。這些結(jié)果可以啟發(fā)未來(lái)與工程界的合作,以最大限度地提高糖生物學(xué)酵母表面顯示管道的效率。事實(shí)上,這種管道對(duì)蛋白質(zhì)很有效,但糖是更困難的目標(biāo),需要對(duì)管道進(jìn)行修改。</p>
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<p>就未來(lái)的應(yīng)用而言,這一創(chuàng)新的潛力從診斷到長(zhǎng)期的治療,并為與麻省理工學(xué)院及其他研究人員的合作鋪平了道路。例如,化學(xué)教授勞拉·基斯林(Laura Kiessling)的研究小組研究結(jié)核分枝桿菌(Mtb),它具有不同尋常的細(xì)胞壁組成,具有獨(dú)特的、獨(dú)特的和獨(dú)特的糖。使用這種方法,粘合劑可以潛在地發(fā)展到Mtb上的特定功能。化學(xué)工程教授Hadley Sikes開(kāi)發(fā)了基于紙張的診斷工具,其中確定了特定表位或標(biāo)記的結(jié)合伙伴,并使用這一發(fā)現(xiàn),從長(zhǎng)遠(yuǎn)來(lái)看,可以開(kāi)發(fā)橫向流動(dòng)檢測(cè)設(shè)備。</p>
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<p><span class="h1"><strong>為未來(lái)的解決方案奠定基礎(chǔ)</strong></span></p>
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<p>在癌癥中,某些糖在細(xì)胞表面的比例過(guò)高,所以理論上,研究人員可以利用這一發(fā)現(xiàn),這也適用于標(biāo)記,從進(jìn)化的聚糖結(jié)合劑中開(kāi)發(fā)一種用于檢測(cè)的工具。</p>
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<p>這一發(fā)現(xiàn)也為改善細(xì)胞成像做出了重大貢獻(xiàn)。研究人員可以使用簡(jiǎn)單的連接策略用熒光團(tuán)修飾粘合劑,然后可以選擇用于組織或細(xì)胞成像的最佳熒光團(tuán)。例如,Kiessling小組可以使用熒光團(tuán)標(biāo)記的小蛋白質(zhì)粘合劑來(lái)檢測(cè)細(xì)菌糖,從而啟動(dòng)熒光激活細(xì)胞分選,以探測(cè)復(fù)雜的微生物混合物。這反過(guò)來(lái)又可以用來(lái)確定病人的微生物群是如何受到干擾的。它也有可能篩選患者口腔或其上或下消化道的微生物群,以使用這些類型的試劑讀出群落內(nèi)的不平衡。在更遙遠(yuǎn)的未來(lái),這種結(jié)合劑可能具有治療目的,例如根據(jù)細(xì)菌顯示的糖來(lái)清除胃腸道或口腔中的特定細(xì)菌。</p>
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<p>注:本文由院校官方新聞直譯,僅供參考,不代表指南者留學(xué)態(tài)度觀點(diǎn)。</p>
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