麻省理工學(xué)院 | 自組裝蛋白可以存儲細(xì)胞“記憶”
指南者留學(xué)
2023-01-03 23:04:07
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<p>當(dāng)細(xì)胞執(zhí)行日常功能時,它們會開啟各種基因和細(xì)胞通路。麻省理工學(xué)院的工程師們現(xiàn)在已經(jīng)誘導(dǎo)細(xì)胞將這些事件的歷史記錄在一條可以用光學(xué)顯微鏡成像的長蛋白質(zhì)鏈中。</p>
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<p>被編程產(chǎn)生這些鏈的細(xì)胞不斷添加編碼特定細(xì)胞事件的構(gòu)建塊。隨后,這些有序的蛋白質(zhì)鏈可以用熒光分子標(biāo)記,并在顯微鏡下讀取,使研究人員能夠重建事件發(fā)生的時間。</p>
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<p>這項技術(shù)可以幫助闡明記憶形成、對藥物治療的反應(yīng)和基因表達(dá)等過程的基礎(chǔ)步驟。</p>
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<p>愛德華·博伊登說:“在器官或身體尺度上,有很多變化發(fā)生在幾小時到幾周的時間里,這些變化是無法隨著時間追蹤的。”他是Y. Eva Tan神經(jīng)技術(shù)教授,麻省理工學(xué)院生物工程、大腦和認(rèn)知科學(xué)教授,霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究所研究員,麻省理工學(xué)院麥戈文大腦研究所和科赫綜合癌癥研究所的成員。</p>
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<p>研究人員說,如果這項技術(shù)可以延長工作時間,它也可以用于研究衰老和疾病進(jìn)展等過程。</p>
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<p>Boyden是這項研究的資深作者,該研究發(fā)表在今天的《自然生物技術(shù)》雜志上。令湖長陽,前麥戈文研究所J. Douglas Tan博士后研究員,現(xiàn)任密歇根大學(xué)助理教授,是該論文的第一作者。</p>
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<p><span class="h1"><strong>手機(jī)的歷史</strong></span></p>
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<p>生物系統(tǒng),如器官,包含許多不同種類的細(xì)胞,它們都有不同的功能。研究這些功能的一種方法是對細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、RNA或其他分子進(jìn)行成像,這可以為細(xì)胞的活動提供線索。然而,大多數(shù)這樣做的方法只提供了一個瞬間的一瞥,或者對非常大的細(xì)胞群不起作用。</p>
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<p>例如,人腦有860億個細(xì)胞。”令狐說。“為了了解這些生物系統(tǒng),我們需要觀察這些大細(xì)胞群中隨著時間的推移發(fā)生的生理事件。”</p>
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<p>為了實現(xiàn)這一目標(biāo),研究小組提出了將細(xì)胞事件記錄為一系列不斷添加到鏈上的蛋白質(zhì)亞基的想法。為了創(chuàng)造它們的鏈,研究人員使用了工程蛋白亞基,這種亞基通常不存在于活細(xì)胞中,可以自組裝成長絲。</p>
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<p>研究人員設(shè)計了一種基因編碼系統(tǒng),其中一種亞基在細(xì)胞內(nèi)持續(xù)產(chǎn)生,而另一種只在特定事件發(fā)生時產(chǎn)生。每個亞基還包含一個非常短的肽,稱為表位標(biāo)簽——在這種情況下,研究人員選擇了稱為HA和V5的標(biāo)簽。這些標(biāo)簽中的每一個都可以結(jié)合到不同的熒光抗體上,這樣就可以很容易地看到標(biāo)簽,并確定蛋白質(zhì)亞基的序列。</p>
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<p>在這項研究中,研究人員將含有v5的亞基的產(chǎn)生取決于一種名為c-fos的基因的激活,這種基因與編碼新記憶有關(guān)。ha標(biāo)記的亞基構(gòu)成了鏈的大部分,但只要V5標(biāo)記出現(xiàn)在鏈中,就意味著c-fos在這段時間被激活了。</p>
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<p>令虎說:“我們希望利用這種蛋白質(zhì)自我組裝來記錄每個細(xì)胞的活動。”“它不僅是時間的快照,還記錄了過去的歷史,就像樹木年輪隨著時間的推移可以永久存儲信息一樣。”</p>
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<p><span class="h1"><strong>記錄事件</strong></span></p>
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<p>在這項研究中,研究人員首先使用他們的系統(tǒng)記錄了在實驗室培養(yǎng)皿中生長的神經(jīng)元中c-fos的激活情況。c-fos基因通過化學(xué)誘導(dǎo)神經(jīng)元的激活被激活,這導(dǎo)致V5亞基被添加到蛋白質(zhì)鏈中。</p>
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<p>為了探索這種方法是否適用于動物的大腦,研究人員對小鼠的腦細(xì)胞進(jìn)行編程,使其產(chǎn)生蛋白質(zhì)鏈,從而揭示動物何時接觸到特定的藥物。后來,研究人員通過保存組織并用光學(xué)顯微鏡分析來檢測暴露。</p>
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<p>研究人員將他們的系統(tǒng)設(shè)計成模塊化,這樣就可以交換不同的表位標(biāo)簽,或者可以檢測到不同類型的細(xì)胞事件,原則上包括細(xì)胞分裂或蛋白質(zhì)激酶的激活,這些酶有助于控制許多細(xì)胞通路。</p>
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<p>研究人員還希望延長他們所能實現(xiàn)的記錄時間。在這項研究中,他們在組織成像前記錄了幾天的事件。在可以記錄的時間量和時間分辨率或事件記錄的頻率之間存在權(quán)衡,因為蛋白質(zhì)鏈的長度受限于細(xì)胞的大小。</p>
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<p>令虎說:“它能存儲的信息總量是固定的,但原則上我們可以減慢或加快鏈的增長速度。”“如果我們想記錄更長的時間,我們可以放慢合成速度,讓它在兩周內(nèi)達(dá)到細(xì)胞的大小。這樣我們就可以記錄更長的時間,但時間分辨率更低。”</p>
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<p>研究人員還致力于對系統(tǒng)進(jìn)行工程設(shè)計,通過增加可以合并的不同子單元的數(shù)量,使其可以在同一鏈中記錄多種類型的事件。</p>
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<p>這項研究由Hock E. Tan和K. Lisa Yang自閉癥研究中心、John Doerr、美國國立衛(wèi)生研究院、國家科學(xué)基金會、美國陸軍研究辦公室和霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所資助。</p>
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<p>注:本文由院校官方新聞直譯,僅供參考,不代表指南者留學(xué)態(tài)度觀點(diǎn)。</p>
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